AG Metzger - Veterinärmedizinische Funktionelle Genomik

Metzger Lab

AG-Leiterin:

Prof. Dr. Julia Metzger

Inhalte unserer Forschung

Unsere Arbeitsgruppe beschäftigt sich mit Variation & Architektur des Genoms und dessen funktionellen Elementen. Dabei greifen wir auf interessante Säugetiermodelle zurück, wie z. B. das Schwein und untersuchen die zugrundeliegenden Mechanismen des Wachstums & der Skelettentwicklung. Hierfür integrieren wir mittels Hochdurchsatz-Sequenzierung gewonnene OMICs-Daten mit zellulären und molekularen Phänotypen aus in vitro Studien.

Diese Grundlagenforschung soll zukünftig dazu beitragen, die zugrundeliegenden Mechanismen für komplexe qualitative Phänotypen, wie das Wachstum eines Organismus, besser zu verstehen und die Ursache von skelett-assoziierten Erkrankungen aufzuklären.

Forschungsprojekte

Laufende Projekte

Aktuelle Forschungsprojekte (Auswahl; DFG-Projekte: siehe DFG GEPRIS) in der funktionellen Genomik

Pig

Wachstum & Krankheit

  • MEASURE: Multi-omics Studien zur Körpergröße im Tiermodell – die genetische Architektur der Körpergröße des Schweines (DFG-Heisenberg-Studie)
  • 3D-DRIVE: Dynamische 3D-Genom Reorganisation des porcinen Wachstums
Bone
  • SKIP: Funktionelle Analyse von skelettmodifizierenden Genen und interkativen Genexpressions-Netzwerken
Footprints
  • SPAID-Forschung: Funktionelle Studien zur Shar Pei Autoinflammatorischen Erkrankung (siehe hier)
Larva

Genomstruktur & Evolution

  • WORMICs: 3D Genomics des Mehlwurms

  • Strukturelle Variation im Zusammenhang mit Domestikation und Selektion von Haustierrassen

 

Eine vollständige Liste der drittmittelbasierten Forschungsprojekte finden sie in der TiHo-Datenbank für Forschungsprojekte

Publikationen

Ausgewählte Publikationen

Genom & Selektionssignaturen:

  • Berghöfer J, Khaveh N, Mundlos S, Metzger J (2022) Simultaneous testing of rule- and model-based approaches for runs of homozygosity detection opens up a window into genomic footprints of selection in pigs. BMC Genomics 23 (1): 1-26. https://doi.org/10.1186/s12864-022-08801-4 (open access)

Wachstumsdefizienzen & Miniaturisierung:

  • Halecker, S., Metzger, J., Strube, C., Krabben, L., Kaufer, B. & Denner, J. (2021) Virological and Parasitological Characterization of Mini-LEWE Minipigs Using Improved Screening Methods and an Overview of Data on Various Minipig Breeds. Microorganisms 9, 9122617. https://doi.org/10.3390/microorganisms9122617
  • Schachler K, Minx J-O, Sürie C, Distl O, Metzger J. (2020) Genetic characterisation of Mini-LEWE as resource population for experimental research. Berliner und Münchener Tierärztliche Wochenschrift 133, DOI: 10.2376/1439-0299-2020-15
  • Metzger J, Rau J, Naccache F, Bas Conn L, Lindgren G, Distl O. (2018) Genome data uncover four synergistic key regulators for extremely small body size in horses. BMC Genomics 19(1):492. https://doi.org/10.1186/s12864-018-4877-5 (open access)
  • Metzger J, Gast AC, Schrimpf R, Rau J, Eikelberg D, Beineke A, Hellige M, Distl O (2017) Whole-genome sequencing reveals a potential causal mutation for dwarfism in the Miniature Shetland pony. Mammalian Genome 28, 143-151. https://doi.org/10.1007/s00335-016-9673-4
  • Metzger J, Distl O (2020) Book section: Genetics of Equine Orthopedic Disease. Veterinary Clinics of North America: Equine Practice, 36 (2): 289-301, Edited by Carrie J. Finno. https://doi.org/10.1016/j.cveq.2020.03.008

Transcriptom und Multi-OMICs Studien in Schwein & anderen Haustieren:

  • Khaveh N, Schachler K, Berghöfer J, Jung K, Metzger J (2023) Altered hair root gene expression profiles highlight calcium signaling and lipid metabolism pathways to be associated with curly hair initiation and maintenance in Mangalitza pigs. Frontiers in Genetics, 14: 1184015. https://doi.org/10.3389/fgene.2023.1184015 (open access)
  • Schachler K, Distl O, Metzger J (2020) Tracing selection signatures in the pig genome gives evidence for selective pressures on a unique curly hair phenotype in Mangalitza. Scientific Reports, 10 (1): 1-12. https://doi.org/10.1038/s41598-020-79037-z (open access)
  • Metzger, J, Schrimpf, R, Philipp, U & Distl, O (2013) Expression Levels of LCORL Are Associated with Body Size in Horses. PLoS ONE 8, https://doi.org/10.1371/journal.pone.0056497 (open access)

Für weitere Publikationen, siehe Google Scholar

Karrieremöglichkeiten

Wir sind immer auf der Suche nach hochmotivierten Wissenschaftlern mit Interesse/Expertise im Bereich Genetik, Genomik, Stammzellentwicklung und bioinformatische Methoden.

Bei Interesse schicken sie bitte eine Bewerbung  (Anschreiben, Lebenslauf, Empfehlungsschreiben von zwei Mentoren) als ein PDF an: julia.metzger@tiho-hannover.de