AG Bioinformatik

AG-Leitung:
Prof. Dr. Klaus Jung

Mitarbeiter:
Dr. Max Hassenstein
Sergej Ruff, M.Sc.
Whitney Tam, M.Sc.

Laufende Projekte:

  • 2024-2028: Landesinitiative Forschungsdatenmanagement Niedersachsen - Säule 2, Förderung durch das niedersächs. MWK
  • 2019-2028: GRK 2485 VIPER (Virus detection, pathogenesis and intervention), Förderung durch die DFG

Abgeschlossene Projekte:

  • 2021-2024: EVOLECTION (System to Evolve productive sow herds by statistic, AI and sensor data driven selection of the tribal sows in criss-cross-breeding),  Förderung durch das BMEL
  • 2020-2024: SMABEYOND (Spinal Muscular Atrophy (SMA) beyond motoneuron degeneration: multi-system aspects), Förderung durch die EU
  • 2019-2023: FibrOmics (Translating Omics studies into clinically relevant insights for lung fibrosis patients), Förderung durch das niedersächs. MWK
  • 2019-2021: DigiStep (Digitalisierungsschritte von Lehrinhalten im Tiermedizinstudium), Förderung durch das niedersächs. MWK
  • 2017-2018: GlykoViroLectinTools (Etablierung von Lektin-Bibliotheken aus Mensch, Schaf und Stechmücken – eine neue Plattform für Bindungsstudien mit viralen Glykoproteinen am Beispiel des Rifttalfiebers), Förderung durch das BMBF
  • 2016-2018: N-RENNT (Niedersachsen-Research Network on Neuroinfectiology), Förderung durch das niedersächs. MWK

Weitere Informationen zu den Projekten finden Sie in der TiHo-Datenbank für Forschungsprojekte

Many molecular high-throughput experiments result in high-dimensional data matrices with the number of features (represented in the rows) being much larger than the number of samples (represented in the columns). Since multiple features are measured on the same experimental unit, the data can be regarded as repeated measurements.
The R-package 'RepeatedHighDim', developed by our group, comprises a selection of functions for different aspects of the analysis of high-dimensional repeated measurements. In particular, functions for 1) outlier detection, 2) differential expression analysis, 3) self contained gene-set tests, and 4) the generation of binary random data.

Download: https://cran.r-project.org/web/packages/RepeatedHighDim/index.html

Tutorial: https://software.klausjung-lab.de/

Wir bieten regelmäßig Stellen für Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter an, die über einen Studienabschluss in Bioinformatik oder einer vergleichbaren Fachrichtung verfügen. Bzgl. offener Stellen und Promotionsmöglichkeiten (auch für Tiermediziner), sowie Themen für Bachelor- oder Masterarbeiten, können Sie uns gerne jederzeit kontaktieren (E-Mail: klaus.jung@tiho-hannover.de oder Telefon: 0511 953-8878).